根据专家確定的治疗方案，整个治疗分两步进行：第一步，在骨肉瘤进行组织切片化验的基础上进行切骨置骨手术，目前已经成功进行；第二步，经过15至20天的恢复期后，再进行化放疗。在置骨手术中，采用了德国进口的具有生物功能的股骨头，手术费用21万。

術後，學校爲嘎瑪旦增請了一位經驗豐富的護工，實行二十四小時特級護理。目前嘎瑪旦增病情平穩，手術的第二天就可以在床上進行右腿膝關節彎曲活動訓練。

爲了解決第一期去骨置骨手術所需要的巨額醫療費用，南通中學的學生走上街頭，向南通社會各界募集70多萬人民幣；同時在校西藏學生向全國各地的內地班發出倡議，已畢業的南通中學西藏籍校友在各大學也自發地加入到捐款行列；江蘇省教育廳有關領導、南通市政府副市長、南通市教育局長、南通市民族宗教事務局領導和社會愛心人士紛紛來到南通醫院看望嘎瑪同學，同時送來治療費。到5月28日爲止，來自政府、學校、社會各界的善款已接近100萬。